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生物信息学研究部11月简报
国家重点研发计划“精准医学研究”项目在清华启动 11月20日，国家重点研发计划项目“精准医学大数据的有效挖掘与关键信息技术开发”的启动会在清华大学信息大楼（FIT楼）召开。国家卫生健康委员会医药卫生科技发展研究中心副主任代涛、清华大学自动化系李衍达院士、北京协和医院副院长张抒扬教授、国家精准医学重点专项专家/中国科学院上海生命科学研究院李亦学教授等多位领导专家出席会议。会议由项目首席科学家、北京信息科学与技术国家研究中心生物信息学部主任、清华大学自动化系张学工教授主持。 代涛主任、李亦学教授等领导专家在会议中致辞，对项目提出了要求和期望，并对团队的建立、工作作风表示了高度认可。张学工教授及6位课题负责人分别从项目及课题的设计、路线、已开展工作等方面作了汇报。李衍达院士、张抒扬教授等专家对项目及课题展开了热烈的讨论，并提出了宝贵建议。最后，张学工教授代表项目组表示，团队将根据专家意见细化、完善实施方案，加强与相关项目的交流合作，并将该项目的研究成果切实应用到临床，为精准医学的防、诊、治作出贡献。 与会专家学者热烈讨论 与会专家学者合影 网络药理学与智慧中医药：世界中医药学会联合会网络药理学专委会第三届学术年会召开 2018年11月9-11日，以“网络药理学与智慧中医药”为主题的第三届世界中医药学会联合会网络药理学专业委员会学术年会在广州隆重召开。大会特邀国内外、网络药理学与中医药相关多学科领域专家展开学术交流及讨论，吸引来自国内外多所高校、科研院所的专家学者和企业代表共计300余人参会。 刘昌孝院士、李济仁国医大师给大会发来了贺信。魏金明社长代表世界中联在致辞中指出，网络药理学使以“一个药物、一个靶标、一种疾病”为主导的研发理念产生了革命性转变,在中医药研究领域产生了深远影响，并高度评价了网络药理学专委会这三年的工作。步长集团赵步长董事长对网络药理学用于揭示中医药的科学内涵、研发具有中医特色的中药新药表达了充分肯定和高度期待。本次大会由专委会会长、清华大学李梢教授主持。李梢教授以“网络药理学与智慧中医药”为题做了主旨报告，介绍了网络药理学自主核心技术和网络靶标原创理论应用于消化道肿瘤“治未病”的新思路、新进展，生动地诠释了以“生物网络靶标”为核心的网络药理学在促进中医药现代化上的关键作用，以及推动形成“智慧+精准”医学模式的美好前景。在本届会议上，包括四位国家杰出青年科学基金获得者在内的28位国内外专家作了学术报告，红日药业、步长制药、江苏康缘、天士力、同仁堂、广州白云山、九芝堂等近20家知名企业参加了企业圆桌论坛。 科研成果： 清华大学微电子与纳电子系任天令教授团队科研人员在 ACS Nano，2018，12：9上发表文章“Multilayer Graphene Epidermal Electronic Skin”，发现了激光直写还原制备石墨烯表层传感器的简化方法，制成了可定制图案的“电子皮肤”，能够附着在多种表面上并实现检测人体运动、生理、发声等多种信号。 […]
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国家重点研发计划“精准医学研究”重点专项“精准医学大数据的有效挖掘与关键信息技术开发”项目在我校启动
2018年11月20日，国家重点研发计划项目“精准医学大数据的有效挖掘与关键信息技术开发”的启动会在清华大学信息大楼（FIT楼）多功能厅召开。国家卫生健康委员会医药卫生科技发展研究中心代涛副主任、清华大学自动化系李衍达院士、北京协和医院副院长张抒扬教授、国家精准医学重点专项专家/中国科学院上海生命科学研究院李亦学教授等多位领导、专家出席了会议。会议由项目首席科学家、北京信息科学与技术国家研究中心生物信息学部主任、清华大学自动化系张学工教授主持。 代主任在启动会中致辞，对项目提出了要求和期望。代主任表示，精准医学大数据的整合、重组、挖掘、利用，是整个精准医学重点研发计划中的重要方面。希望各项目和课题组之间加强交流合作，严格按照任务书的要求高质量完成任务，实现精准医学的可持续发展。 李亦学教授则从精准医学项目专家组的角度，对本项目在整合国内最优秀的团队尤其是年轻科学家方面所进行的努力，表达了高度赞许。李教授同时表示，项目首席张学工教授对管理大型研究团队有丰富的经验，在大局观和细节把控方面，平衡的很好，尽管项目任务非常重，他对项目团队抱有充分的信心。 接下来，张学工教授及六位课题负责人分别从项目及课题的设计、研究目标、研究内容、技术路线、进度安排、已开展工作及成果等方面进行了汇报。 听取完汇报后，与会专家与项目组成员进行了热烈的讨论。李衍达院士从项目的医学复杂性、交叉融合性和动态扩展性三个方面提出了建议，鼓励项目组成员运用生物信息学知识为国民健康做出贡献。张抒扬教授提出，项目要切实考虑临床需求，以若干个具体疾病作为抓手，真正达到临床转化的目的。此外，李亦学教授、何作祥教授、魏文强教授、宋江平教授、吕晖教授、方向东教授等专家也分别提出了建议。 最后，张学工教授代表项目组表示，团队将根据专家意见细化、完善实施方案，加强与相关项目的交流合作，并将该项目的研究成果切实应用到临床，为精准医学的防、诊、治做出贡献。 该项目将解决“复杂多元异构大数据有效整合与深度挖掘”、“多类精准医学大数据的高精度处理和高效并行计算与云计算”及“针对科研与临床诊疗的全链条技术方法体系”三大科学问题，为国家搭建一套开放共享的精准医学技术服务平台。 参会领导、专家及课题骨干合影
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生物信息学研究部10月简报
10月3日，张学工应邀访问哈佛大学统计系并在Jun S. Liu教授实验室作了题为Informatics observations on single-cell RNA-seq data and HCA的学术报告。 10月5-7日，由汪小我和谢震担任指导教师的本科生合成生物学竞赛团队在中国科技馆举办了“从微生物到生物传感器——揭秘合成生物学科普展览”。 10月6日，张学工应邀出席2018北美清华自动化论坛（波士顿）并作了题为“从自动化到基因、细胞、智能医疗”的主题讲演。 10月11、12日，中国医师协会临床医疗专业委员会在济南举行以“大数据、人工智能与精准医学”为主题的2018年会暨第三届精准医学高峰论坛，张奇伟应邀作题为“A Tale of DNA loops in Globin Gene Cluster Locus”的主题报告、李梢应邀作题为“基于生物网络的胃癌中西医智慧医疗”的主题报告、古槿应邀作题为“肿瘤单细胞转录异质性分析”的主题报告。 10月12日，张学工应邀出席第三届中美肿瘤精准医学高峰论坛，并作了题为Analyzing bioinformatics methods for […]
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生物信息学研究部9月简报
2018年8月30日-9月1日，清华大学北京信息科学与技术国家研究中心生物信息学研究部在三堡召开了2018年度学术交流会。交流会包括了教师报告2个、博士生口头学术报告19个、博士生硕士生张贴报告38个、专题讨论会4场，并举办了2018级研究生新生欢迎活动。参加学术交流会的教师有：张学工、李梢、任天令、陈挺、姜涛、江瑞、汪小我、谢震、马骋、古槿、闾海荣、陈阳、高军涛、路海明、刘莉扬、师明磊等，研究部来自自动化系、计算机系、医学院、微电子所的研究生和博士后共120多人参加了此次交流会。这是国家研究中心组建后以研究部组织的首次大规模学术活动。 2018年8月23日，国家卫生计生委医药卫生科技发展研究中心公布了国家重点研发计划“精准医学研究”重点专项2018年度拟立项的6个重点项目，清华大学张学工教授作为首席科学家的项目“精准医学大数据的有效挖掘与关键信息技术研发”获批。该项目旨在针对多种重要疾病，系统地开展精准医学大数据的有效挖掘与关键信息技术研发，为精准医学研究提供各种组学及表型数据的有效处理方法、软件和信息技术。项目包括两大研究重点：精准医学复杂数据的分析挖掘与先进计算。前者的核心是高水平精准医学大数据分析方法体系，包括基因组学与表观遗传数据深度挖掘、多维生命组学整合分析、组学与疾病表型数据整合分析；后者的重点是高效算法与并行计算、云存储与云计算。 2018年9月5日，李梢教授应邀在第二届临床中药学大会作题为“网络药理学与临床中医药”的特邀报告。 2018年9月7日至9日，北京信息科学与技术国家研究中心张学工教授、江瑞副教授、闾海荣副研究员在福州出席由福建省医学会肝病学分会主办，福建医科大学孟超肝胆医院、福建吴孟超科技教育发展基金会承办的健康医疗大数据新观念新技术学习班，进行人才培训。该学习班在福州市福建会堂举办。在培训中，张学工教授讲授“从基因组学、大数据、人工智能看未来普惠医疗”的主题培训报告。江瑞作“华佗医学大脑在肝胆大数据中的应用”的培训。闾海荣作“一种新的医疗大数据共享和隐私保护体系架构”的培训。参加培训的学员约100余名。 2018年9月7日，李梢教授应邀在中国中医药信息研究会临床研究分会第三届学术年会作题为“网络药理学与中医药人工智能”的特邀报告。 2018年9月16日，李梢教授应邀在第五届世界中医药教育大会中药及天然药物国际论坛作题为“网络药理学与精准中医药”的特邀报告。 2018年9月27-28日，张学工应邀出席国家自然科学基金医学部组织的“组织器官区域免疫特性与疾病学科交叉专题战略研讨会“，并作题为”单细胞组学数据分析的生物信息学方法“的开场学术报告。 清华大学微纳电子系任天令教授团队在《美国化学会纳米》（ACS Nano）上发表了题为上发表了题为《用于人体运动检测的负电阻变化石墨烯织物应变传感器》（“Graphene Textile Strain Sensor with Negative Resistance Variation for Human Motion Detection”）的研究论文。该传感器呈现出一种全新的现象，显示出负电阻变化特征，传感器与衣物完美贴合，可以直接缝制在衣物上用于检测腹式呼吸速率、脉搏等。该传感器真正实现了与服装完美的集成，在生理信息检测和人体活动监测等方面有着重大的应用前景。 近年来，柔性力学传感器在人体生理信号检测方面的应用已经日渐成为了学术界的研究热点。传统的电阻型力学传感器大多采用的是导电材料与高分子柔性衬底的结合体制备而成，虽然也具有柔性特点，但是由于高分子的不透气性，长时间与人体接触会造成不适感。 任天令教授团队基于高温还原石墨烯，将石墨烯与织物相结合，不需要传统的高分子聚合物进行塑封，真正实现了器件与衣物的完美融合。通过电阻变化对人体各种运动进行监测。器件经过水洗处理，依然保持较高的稳定性，石墨烯起到“染色剂”的作用，对衣物进行染色，赋予器件优异的性能。该器件在监测人体生理信号方面有着优异的性能，例如脉搏，腹式呼吸，关节运动和面部表情，还能实现对走，跑等走路姿态的监测。
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生物信息学研究部7月-8月简报
2018年7月14日，生物信息学研究部李梢教授应邀在第16届全国中西医结合肿瘤学术大会作题为“基于网络药理学的中西医结合肿瘤研究探索”的大会报告。 2018年7月19日-20日，高军涛副研究员应邀参加《Light：Science and Applications》杂志在中国长春举办的“Light Conference－青年科学家论坛2018”会议，并做题为“Novel Imaging methods for 3D Genome”的报告。 2018年7月31日-8月2日，生物信息学研究部张学工教授应邀在GFS2018第五届基因组前沿研讨会上以“Some informatics observations on single-cell RNA-seq data”为题作大会主题报告。 2018年8月3日，张学工教授应邀出席2018年中国心脏大会，并作了“A quick view on single-cell bioinformatics”的专题报告。 2018年8月25日，李梢教授应邀在香港举办的The 4th International Summit on Innovative Drug […]