清华合成与系统生物学中心
Tsinghua Center for Synthetic and Systems Biology
陈阳
Yang Chen

Assistant Researcher






Contact Information
E-mail:
yc@tsinghua.edu.cn
Tel: +86-10-62795578
Fax: +86-10-62786911

Education
1998.09-2002.07,中山大学,生命科学学院,药学专业(学士)
1999.09-2001.07,中山大学,信息科学与技术学院,计算机软件与工程专业(辅修)
2002.09-2005.07,北京协和医学院,免疫学专业(硕士)
2005.09-2008.07,北京协和医学院,生化与分子生物学专业(博士)

Working Experience
2008.07-2011.06,清华大学,自动化系,生物信息学实验室(博士后)
2011.08-至今,清华大学,清华信息科学与技术国家实验室(筹),生物信息学部/合成与系统生物学中心 (助理研究员)

Research Interest
肿瘤发生发展过程中的基因表达调控网络构建与分析。

Publications
1. Yang Chen*, Jin Gu*, Dan Li, Greg Vatcher , Shao Li. Time-course network analysis reveals TNF-{alpha} can promote G1/S transition of cell cycle in vascular endothelial cells. Bioinformatics, 2012, 28:1-4 (* shows co-first author)
2. Jin Gu, Yang Chen, Shao Li, Yanda Li. Systematic identification of the responsive gene modules and microRNAs of the human umbilical vascular endothelial cells in inflammation. BMC System Biology, 2010, 4: 47.
3. Pufeng Du*, Yang Chen*, Yanda Li. Computational evidence of A-to-I RNA editing in nucleus transcriptome of Arabidopsis thaliana. Frontiers of Electrical and Electronic Engineering in China, 2009, 4(4):349-361. (EI) (* shows co-first author)
4. Jianyan Wen, Qing Xia, Cheng Wang, Wei Liu, Yang Chen, Jing Gao, Yanhua Gong, Bin Yin, Yuannan Ke, Boqin Qiang, Jiangang Yuan, Xiaozhong Peng. Dok5 is involved in cardiomyocyto differentiation through PKB/FOXO3a pathway. Journal of Molecular and Cellular Cardiology, 2009,47(6):761-769.
5. Yu Zhang, Tengfei Chao, Ran Li, Yang Chen, Xingqi Yan,Yanhua Gong, Bin Yin, Boqin Qiang, Jiangang Yuan, Xiaozhong Peng. MicroRNA-128a inhibits glioma cells proliferation by targeting transcription factor E2F3. Journal of Molecular Medicine, 2009, 87(1):43-51.
6. Yang Chen, Wei Liu, Tengfei Chao, Yu Zhang, Xinqi Yan, Yanhua Gong, Boqin Qiang, Jiangang Yuan, Maosheng Sun, Xiaozhong Peng. MicroRNA-21 Down-regulates the Expression of Tumor Suppressor PDCD4 in Human Glioblastoma cell T98G. Cancer Letters, 2008,272 (2):197-205.
7. 陶里, 段金梅, 舒晓明, 胡凝珠, 兰芸, 陈阳, 白巍. 三七皂苷R1对铝佐剂甲型肝炎疫苗的免疫增强作用. 中国生物制品学杂志,2008年,21(3):197-200.
8. 舒晓明, 胡凝珠, 兰芸, 陶里, 陈阳, 罗爱华, 胡云章. 低分子量透明质酸增强HAV抗原诱导的小鼠体液免疫应答的研究.细胞与分子免疫学杂志,2008年,24(2):183-185.
9. 陈阳, 李健峰, 姬秋彦, 闫玲梅, 龙海亭, 徐维明.幽门螺杆菌oipA基因的克隆及其生物信息学分析.世界华人消化杂志 2005年 4月;13(7):867-870.
10. 陈阳, 徐维明.蛋白质组学技术在幽门螺杆菌研究中的应用.世界华人消化杂志 2005年 1月;13(2):243-245.


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