2019国际单细胞组学中国峰会在清华大学举行 

        2019525日,由清华大学发起、清华大学与两家国际高科技公司共同主办的“2019国际单细胞组学中国峰会”在清华科技园国际会议中心召开。峰会主题为“构建细胞图谱、赋能细胞医疗”,是我国主办的以人类细胞图谱(HCA)为目标的第一次国际学术会议。会议由自动化系教授、北京信息科学与技术国家研究中心生物信息学研究部主任张学工主持,HCA计划的双发起人之一、美国科学院院士、MIT/哈佛大学伯德研究所(Broad Institute)的Aviv Regev教授出席会议并作大会主题报告,来着美国、英国、日本和中国的18位本领域代表性学者作大会报告或参加圆桌论坛,陈扎克伯格基金会HCA项目主管Jonah Cool博士作报告并参加圆桌论坛,清华大学医学院董晨院长出席,北医三院院长乔杰院士出席并作大会报告,国家卫生健康委医药卫生科技发展研究中心处长闫力出席并致词。峰会得到了全国和国际同行的高度关注,现场参会和远程观看视频直播的学者超过4500人。

以单细胞组学和生物信息学技术为基础的国际人类细胞图谱HCA计划,旨在通过全球科学家合作建立人类全部细胞类型与状态的分子特性图谱,是继人类基因组计划后又一个具有奠基性意义的重大国际科学计划。该计划目前仍处在初始阶段,陈扎克伯格基金会和美国NIH、英国Wellcome Trust等多个国立和民间科学基金已经对项目提供支持。本次峰会的报告和圆桌论坛,展示了该领域单细胞组学和生物信息学技术在国际和中国的最新发展和未来趋势,也就本领域技术标准、科学伦理、数据共享和全球合作等重要议题开展了深入讨论。

Aviv Regev院士(左上)、乔杰院士(中)等作大会报告和圆桌论坛

峰会现场

现场参会人员合影

李梢课题组在Cell子刊首次报道胃癌极早期细胞标志物

 

胃癌是我国高发的恶性肿瘤,且发病率长期居高不下,严重危害人民健康。胃炎癌转化是胃癌高发的一个重要因素。近期,信息国家研究中心生物信息学研究部李梢课题组首次成功捕捉到胃癌发生的单细胞信号及其网络关联,突破性地发现了胃癌极早期细胞标志物,在胃癌精准防控和“治未病”方面取得了重大进展。该研究成果2019年5月7日以“Dissecting the single-cell transcriptome network underlying gastric premalignant lesions and early gastric cancer” (《解析胃癌前病变和早期胃癌的单细胞转录组网络》)为题发表于著名学术刊物Cell的子刊Cell Reports。

李梢课题组前期研究发现中医寒热相关代谢-免疫网络失衡加剧、会促进胃炎癌转化。该研究采集了具有胃灼痛、大便干燥、舌苔黄或厚等若干“胃火”相关临床表现的胃炎和胃早癌患者,对患者进行了中、西医特征的全面诊查,并率先开展单细胞转录组测序。通过克服微量细胞分离、异质单细胞数据整合等系列技术难点,课题组首次成功捕获了胃癌前病变及早期胃癌患者胃组织中50,000余个细胞,并对每个细胞进行了转录组检测,建立了迄今最大规模的人体胃组织单细胞图谱。进而,对图谱中单个细胞的特征进行深入计算解析,从中识别出包括胃癌极早期细胞在内的胃炎癌转化过程中17种重要细胞类型,并建立了不同细胞类型之间的定量关联关系,首次构建出胃炎癌转化单细胞网络,实现了从单细胞层次对胃炎癌转化网络机制的全面解析,为系统揭示胃癌发生的生物学基础提供了一个新视角。尤为重要的是,该研究通过系统分析胃早癌细胞与其他上皮细胞群之间的网络关联,还突破性地发现胃炎肠化早期、胃癌极早期的两类细胞及其标志物,有望助力胃癌前病变、胃癌的极早期发现和中西医精准诊断。这两种标志物已申请发明专利,正进行试剂盒研制和更大规模的临床验证。

该文被审稿人高度评价为“非常好的论文”、“值得快速发表和推广”。李梢指导的博士生张鹏为该文第一作者,李梢教授为该文通讯作者,中日友好医院医生杜时雨在样本采集上提供了重要帮助。该研究得到国家自然科学基金重点项目、集成项目等的支持。

学术交流:

2019年5月6日至8日,由国家互联网信息办公室、国家发展和改革委员会、工业和信息化部、福建省人民政府共同主办的第二届数字中国建设峰会在福建省福州市举办。生物信息学研究部李梢教授应邀参加第二届数字中国峰会主论坛。李梢教授团队研制的“胃健康–精准中医”等系列成果参加了峰会展示,吸引了大量市民的驻足体验和咨询。观众们目睹了大数据时代中医药的创新发展,切身体会到了清华“核芯”技术助力福州百姓胃健康和中医药伟大复兴的重大意义。

 2019年5月4日,李梢教授应邀在清华大学中西医结合2019创新论坛作题为“网络药理学:中医药系统性研究新方法”的特邀报告。

2019年5月24日,李梢教授应邀在清华大学研究生会组织的“大师微沙龙”进行了以“生物信息学与中医药现代化”为主题的座谈。

2019年5月23日,汪小我应邀在中国科普研究所作题为“人工合成生物系统简介”的特邀报告。

2019年5月24日,应生物信息学研究部邀请,中国军事科学院军事医学研究院伯晓晨研究员到研究部交流,并作题为“ 面向生物威胁快速反应的大数据分析技术”的特邀报告。